南通市第一人民医院药剂科是国家临床药师培训基地，市级临床重点建设专科。近年来相继荣获“江苏省规范药房”、“南通市示范药房”、“南通市一级药房”、“医疗机构药品‘四星级单位”等多项称号，连续多年被评为“南通市药品不良反应监测先进单位”。目前拥有调剂部门（包括门诊药房、急诊药房、病区药房）、质检室、药库、临床药学室、药学信息室等多个部门。药剂科是集药品供应管理、教学科研、临床药学服务为一体的综合性科室。承担着全院各科室门诊及病区用药的供应和管理工作以及合理用药与咨询、药品不良反应监测、药学信息服务等临床药学工作。